Bioinfo1 Regulatorische Genomik – MoBi Bachelor – WS 2019/2020¶
Carl Herrmann carl.herrmann (at) uni-heidelberg.de
Inhalt der Vorlesung¶
Aspekte der transktionnellen Regulation
Experimentelle Methoden in der regulatorischen Genomik (ChIP-seq / ATAC-seq / …)
Beschreibung der Bindung von Transkriptionsfaktoren
Bindemotive / Position-frequency matrix / Logos
Vorhersagen von Bindestellen für TFs
Rolle der epigenetischen Faktoren
Hidden Markov Modelle / Expectation Maximization
News¶
Besprechung der Übungsblätter Montags, 10 - 11 Uhr
Vorlesungen: Montags 11 - 13 Uhr / Freitags 8 - 10 Uhr
Klausurtermin: 10.02.2020 14 - 16 Uhr (INF306 / HS1)
Links¶
Beispiel zum Thema Hidden Markov Models; hier das entsprechende Markdown file
hmm.Rmd
Beispiel zum Thema Expectation Maximization; hier das entsprechende Markdown file
em.Rmd